En Burghausen hay tres escuelas primarias, una secundaria, una secundaria y dos secundarias. La ciudad de Burghausen se hace cargo de los gastos materiales de las escuelas primarias y secundarias. La ciudad es financieramente responsable de estas escuelas.
Las escuelas primarias son la escuela primaria Hans Kammerer y la escuela primaria Johannes Hess, ambas en Neustadt. La Escuela Hans-Stethaimer se encuentra en el casco antiguo. En el edificio de la escuela, la Escuela Hans-Stethaimer también alberga una sucursal de la Escuela Pestalozzi, un centro de educación especial en Neuötting. La sucursal en Raitenhaslach también pertenece a la Escuela Hans Stethaimer.
Los niños son asignados a las distintas escuelas primarias por el distrito escolar de la autoridad escolar de Altötting.
Las escuelas secundarias en Burghausen son Franz-Xaver-Gruber-Middle School, Maria-Ward-Realschule, Aventinus- y Kurfürst-Maximilian-Gymnasium.
