El escudo de armas de la ciudad de Burghausen se documenta por primera vez en el sello de un documento de 1290. Sin embargo, este sello se perdió. La representación más antigua que existe del sello de la ciudad con el escudo de armas de la ciudad data de 1332 y autentica un acta de fundación del hospital Burghausen. El acta de fundación se encuentra en el archivo de la ciudad de Burghausen.
Los escudos, banderas y sellos oficiales de los municipios son símbolos patrios. Por lo tanto, los escudos de armas y las banderas solo pueden ser utilizados por terceros con el permiso del municipio respectivo. La descripción oficial del escudo de armas de Burghausen dice: "En rojo sobre una triple colina verde, un castillo plateado con una puerta dorada abierta. Tres torres, siendo la del medio más alta y ancha; los techos son dorados.
En 1255, cuando se dividió el estado bávaro, Burghausen cayó ante el duque Heinrich von Niederbayern, quien desarrolló Burghausen como residencia junto a Landshut. El escudo de armas muestra la importancia de Burghausen como ciudad con una muralla y una puerta abierta. El Dreiberg solo se agregó al escudo de armas en 1416.
Los colores del escudo de armas actual de la ciudad se han transmitido desde 1605. En contraste, los techos se mostraron en azul en 1912 y 1964. Sin embargo, según un informe de la Dirección General de los Archivos Estatales de Baviera de 1977, es decisiva la descripción más antigua del escudo de armas con los techos dorados, que también ha sido válida desde entonces.